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Python鸢尾花数据绘制P-R曲线
一、性能度量
性能度量目的是对学习期的泛华能力进行评估,性能度量反映了任务需求,在对比不同算法的泛华能力时,使用不同的性能度量往往会导致不同的评判结果。常用度量有均方误差,错误率与精度,查准率与查全率等。
1.错误率与精度
这两种度量既适用于二分类任务,也适用于多分类任务。错误率是分类错误的样本数占样本总数的比例,精度则是分类正确的样本数占样本总数的比例。
2.查准率、查全率与F1
查准率(precision)与查全率(recall)是对于需求在信息检索、Web搜索等应用评估性能度量适应度高的检测数值。对于二分类问题,可将真实类别与算法预测类别的组合划分为真正例(ture positive)、假证例(false positive)、真反例(true negative)、假反例(false negative)四种情形。显然TP+FP+TN+FN=样例总数。分类结果为混淆矩阵:
真实情况 预测结果 正例 反例 正例 TP(真正例) FN(假反例) 反例 FP(假正例) TN(真反例)
查准率P定义为:
一般来说。查准率高时,查全率往往偏低;而查全率高时,查准率往往偏低。通常只有一些简单任务中,才可能使查全率和查准率都很高。
二、代码实现:
1.基于具体二分类问题算法实现代码:
import numpy import matplotlib from matplotlib import pyplot as plt # true = [真实组1,真实组2...真实组N],predict = [预测组1,预测组2...预测组N] def evaluation(true, predict): num = len(true) # 确定有几组 (TP, FP, FN, TN) = ([0] * num for i in range(4)) # 赋初值 for m in range(0, len(true)): if (len(true[m]) != len(predict[m])): # 样本数都不等,显然是有错误的 print("真实结果与预测结果样本数不一致。") else: for i in range(0, len(true[m])): # 对每一组数据分别计数 if (predict[m][i] == 1) and ((true[m][i] == 1)): TP[m] += 1.0 elif (predict[m][i] == 1) and ((true[m][i] == 0)): FP[m] += 1.0 elif (predict[m][i] == 0) and ((true[m][i] == 1)): FN[m] += 1.0 elif (predict[m][i] == 0) and ((true[m][i] == 0)): TN[m] += 1.0 (P, R) = ([0] * num for i in range(2)) for m in range(0, num): if (TP[m] + FP[m] == 0): P[m] = 0 # 预防一些分母为0的情况 else: P[m] = TP[m] / (TP[m] + FP[m]) if (TP[m] + FN[m] == 0): R[m] = 0 # 预防一些分母为0的情况 else: R[m] = TP[m] / (TP[m] + FN[m]) plt.title("P-R") plt.xlabel("P") plt.ylabel("R") #plt.plot(P, R) #plt.show() if __name__ == "__main__": # 简单举例 myarray_ture = numpy.random.randint(0, 2, (3, 100)) myarray_predict = numpy.random.randint(0, 2, (3, 100)) evaluation(myarray_ture,myarray_predict)
下面给出利用鸢尾花数据集绘制P-R曲线的代码(主要体现其微互斥性)
2.利用鸢尾花绘制P-R曲线
from sklearn import svm, datasets from sklearn.model_selection import train_test_split import numpy as np iris = datasets.load_iris() # 鸢尾花数据导入 x = iris.data #每一列代表了萼片或花瓣的长宽,一共4列,每一列代表某个被测量的鸢尾植物,iris.shape=(150,4) y = iris.target #target是一个数组,存储了data中每条记录属于哪一类鸢尾植物,所以数组的长度是150,所有不同值只有三个 random_state = np.random.RandomState(0) #给定状态为0的随机数组 n_samples, n_features = x.shape x = np.c_[x, random_state.randn(n_samples, 200 * n_features)] #添加合并生成特征测试数据集 x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(x[y < 2], y[y < 2], test_size=0.25, random_state=0) #根据此模型训练简单数据分类器 classifier = svm.LinearSVC(random_state=0)#线性分类支持向量机 classifier.fit(x_train, y_train) y_score = classifier.decision_function(x_test) from sklearn.metrics import precision_recall_curve import matplotlib.pyplot as plt precision, recall, _ =precision_recall_curve(y_test, y_score) plt.fill_between(recall, precision,color='b') plt.xlabel('Recall') plt.ylabel('Precision') plt.ylim([0.0, 1.0]) plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.plot(recall, precision) plt.title("Precision-Recall") plt.show()
效果:
P-R图直观的显示出学习器在样本上的查全率、查准率。在进行比较时,若一个休息区的P-R曲线被另一个学习器的曲线完全“包住”,则可断言后者的性能优于前者。为取得比较合理的判断依据,将采用“平衡点”(Break-Even Point,BEP)度量对比算法的泛华性能强弱。它是“查准率=查全率”时的取值。但BEP还是过于简化,更常用F1度量(all为样例总数):
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